-
ענף (פילוגנטיקה)
כל מה שרצית לדעת על ענף (פילוגנטיקה):בביולוגיה סיסטמטית, ענף או קלייד (מאנגלית: clade) היא קבוצה טקסונומית (קבוצה במיון עולם הטבע) ופילוגנטית הכוללת אורגניזם מסוים ואת כל צאצאיו, כלומר ענף שלם בעץ הפילוגנטי.המונח נטבע ב-1958 על ידי הביולוג האנגלי ג'וליאן האקסלי (Huxley).הקלדיסטיקה (בעברית: "עינוף" או "מיון לענפים"), שהיא הגישה הממיינת את האורגניזמים השונים לענפים, מכירה רק…
-
פילוגנטיקה
כל מה שרצית לדעת על פילוגנטיקה :פילוגנטיקה (מיוונית, "פילו" – שבט או גזע, "ג'נסיס" – לידה או גנטיקה) הוא תחום בביולוגיה, העוסק בחקר הקרבה האבולוציונית בין קבוצות אורגניזמים שונות. ניתוח פילוגנטי משמש בכווני מחקר שונים, ביניהם אקולוגיה, בה טקסונומיה וסיסטמטיקה פילוגנטית מאפשרות מיון היררכי של הקבוצות השונות לדרגות, וכן ביואינפורמטיקה, אפידמיולוגיה וחקר חלבונים. נלקח מויקיפדיה…
-
פילוגנטיקה
כל מה שרצית לדעת על פילוגנטיקה:פילוגנטיקה (מיוונית, "פילו" – שבט או גזע, "ג'נסיס" – לידה או גנטיקה) הוא תחום בביולוגיה, העוסק בחקר הקרבה האבולוציונית בין קבוצות אורגניזמים שונות. ניתוח פילוגנטי משמש בכווני מחקר שונים, ביניהם אקולוגיה, בה טקסונומיה וסיסטמטיקה פילוגנטית מאפשרות מיון היררכי של הקבוצות השונות לדרגות, וכן ביואינפורמטיקה, אפידמיולוגיה וחקר חלבונים. נלקח מויקיפדיה הגדרות…
-
פוליפילטיות
כל מה שרצית לדעת על פוליפילטיות:בפילוגנטיקה, קבוצת אורגניזמים נקראת פוליפילטית (מיוונית: פולי = הרבה, פילה = גזע), אם האב הקדמון המשותף המאוחר ביותר של כל חברי הקבוצה אינו כלול בקבוצה. מיני הקבוצה נכללים בה יחדיו בשל מאפיין הומופלסי אחד או יותר בו הם ניחנים.קבוצות שבהן האב הקדמון המשותף של כל חברי הקבוצה כלול בקבוצה נקראות…
-
תומאס ר. הולץ הבן
כל מה שרצית לדעת על תומאס ר. הולץ הבן:ד"ר תומאס ריצ'רד הולץ הבן (נולד ב-1965 בלוס אנג'לס) הוא דוקטור לפלאונטולוגיה של בעלי חוליות ומרצה בכיר במחלקה לגאולוגיה באוניברסיטת מרילנד. הולץ מתמחה בפלאונטולוגיה של דינוזאורים ובפרט בחקר התרופודה – סדרת הדינוזאורים הטורפים לה שייך טירנוזאורוס ושממנה התפתחו העופות. הולץ הוא מחבר הספר Dinosaurs: The Most Complete,…
-
פרימיטיביות
כל מה שרצית לדעת על פרימיטיביות:בשיח האבולוציוני והאנתרופולוגי, פְּרִימִיטִיבִיוּת (מהמילה "פרימוס" שמשמעותה "ראשון") היא אפיון הנקשר למינים אלה ואחרים, או תכונות, השייכים לאוסף פרטים קדמוני, ולדרגה התפתחותית קדומה או ראשונית, ביחס למתבונן או לשלב היסטורי או ביולוגי נתון. סיווגו של אורגניזם – או מעשה אמנות – כפרימיטיבי מציין את היותו פחות מורכב משלבים אפשריים מאוחרים…
-
סינטניה
כל מה שרצית לדעת על סינטניה:בגנטיקה קלאסית, המושג סינטֶניה (synteny; מיוונית: "מאותו קטע") מתאר את הימצאותם של גנים על גבי אותו כרומוזום. כיום המושג משמש גם לתיאור לא רק עצם הימצאותם אלא גם לתיאור הרצף הספציפי של הגנים על גבי הכרומוזום, ולשם כך משמש גם המונח "סינטניה משותפת" (shared synteny).המושג הקלאסי התבסס על צימוד גנטי…
-
פרפילטיות
כל מה שרצית לדעת על פרפילטיות:בפילוגנטיקה, קבוצת אורגניזמים נקראת "פָּרָפִילֵטית" (מיוונית – פרה = קרוב, פילה = גזע) אם האב הקדמון המשותף המאוחר ביותר של האורגניזמים בקבוצה נכלל בה, אך לא כל צאצאיו נכללים בקבוצה. קבוצות המכילות את כל הצאצאים של האב הקדמון המשותף שלהן נקראות קבוצות "מונופילטיות" או "הולופילטיות". קבוצות הנגזרות מכמה ענפים שונים…
-
הומופלסיה
כל מה שרצית לדעת על הומופלסיה:למעלה: המין Vestiaria coccinea (ימין) מקבוצת ה-Carduelinae והמין Phaethornis guy מקבוצת הקוליבריים (שמאל).למעלה: המין Cinnyris jugularis מקבוצת הצופיתיים (ימין) והמין Cyanerpes caeruleus (שמאל) מהסוג Cyanerpes.הומופלסיה (Homoplasy) מוגדרת כאבולוציה עצמאית של מאפיין או מצב מאפיין דומים אצל שני מינים או יותר, כלומר כאלו שלא נרכשו מאביהם הקדמון המשותף. במילים אחרות, בתופעה…
-
עץ פילוגנטי מושלם
כל מה שרצית לדעת על עץ פילוגנטי מושלם:עץ פילוגנטי מושלם הוא מונח מתחום הביולוגיה החישובית המציין עץ פילוגנטי שכל הצמתים הפנימיים שלו יכולים להיות מתוייגים בצורה כזו שכל התכונות עוברות אבולוציה במורד העץ ללא הומופלסיה, כלומר התכונות לא עוברות אבולוציה מתכנסת וכל צומת בעץ הוא אב קדמון משותף של הענפים היוצאים ממנו. ערך זה הוא…