כל מה שרצית לדעת על Shotgun sequencing:
בגנטיקה, shotgun sequencing או shotgun cloning (בתרגום מילולי: ריצוף בשיטת רובה הציד) היא שיטה המשמשת לריצוף גדילי DNA ארוכים.
שיטה זו נקראת כך כאנלוגיה לדפוס הירי האקראי למחצה והמתפשט במהירות של רובה הציד.
מאחר ששיטת ה-chain termination ("סיום השרשרת", מכונה גם ריצוף בשיטת סנגר) לריצוף DNA יכולה לשמש רק עבור גדילים קצרים יחסית (100 עד 1000 בסיסים), יש לחלק את הרצפים הארוכים יותר לחתיכות קטנות יותר, ולאחר מכן לחבר אותן מחדש על מנת לקבל את הרצף הכולל.
שתי שיטות עיקריות משמשות לצורך כך:chromosome walking ("טיול על הכרומוזום") – שיטה בה מתקדמים לאורך כל הגדיל, חתיכה אחר חתיכה.
ריצוף בשיטת shotgun sequencing – תהליך מהיר יותר אך מורכב יותר, המשתמש ברצפים אקראיים.
בשיטת ה-shotgun sequencing, שוברים את ה-DNA באופן אקראי למקטעים קטנים רבים והם מרוצפים בשיטת ה-chain termination על מנת לקבל את הקריאות (reads).
לאחר ביצוע חזרות רבות של פרגמנטציה וריצוף מתקבלות חפיפות רבות של הקריאות עבור ה-DNA הנחקר.
בשלב הבא, תוכנות מחשב משתמשות בקצוות החופפים של קריאות שונות על מנת להרכיב אותן לרצף יחיד.
שיטה ה-shotgun sequencing הייתה אחת הטכנולוגיות הראשונות שאיפשרו ריצוף מלא של הגנום.

נלקח מויקיפדיה

הגדרות נוספות הקשורות לShotgun sequencing:
•גנטיקה
•שיטות ריצוף DNA